求臻医学全满分通过2020年CAP MSI-A能力验证

2020-12-14 求臻医学企宣

求臻医学

近日,美国病理学家协会(College of American Pathologists,CAP)公布了MSI-A 2020 (Microsatellite Instability)能力验证(Proficiency Testing,PT)项目的评估结果,求臻医学完美通过了本次CAP能力评估。

本次MSI-A 2020 CAP PT项目吸引了全球159家实验室参与其中。该项目中MSI-01为组织样本,MSI-02和MSI-03为MSIPhotograph Challenge,求臻医学均给出了正确的检测结果,有力证明了求臻医学MSI样本检测能力获得了国际认可!


CAP能力验证MSI-A2020项目成绩单

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MSI是MMR蛋白功能缺陷导致的结果。MMR蛋白功能缺陷同时也会导致基因组呈现高突变表型,进而导致肿瘤发生风险增加。目前,MSI检测被美国国立综合癌症网络(NCCN)结直肠癌临床实践指南及中国临床肿瘤学会(CSCO)结直肠癌诊疗指南推荐用于所有结直肠癌患者。此外,MSI检测对于子宫内膜癌、卵巢癌、肺癌、乳腺癌和胰腺癌在内的多种实体瘤患者均具有重要临床意义。


求臻医学生信团队研发了首个基于NGS数据检测患者MSI状态的算法MSIsensor,被应用于FDA批准的首个基于NGS的癌症多基因检测试剂盒(MSK-IMPACT)。在此基础上,求臻生信团队分别为基于人工智能技术的适用于单肿瘤测序数据和外周血游离DNA(cfDNA)测序数据进行MSI状态检测的软件MSIsensor2与MSIsensor-ct。


MSIsensor2对各类型测序数据广泛适用,且对于测序深度30X以上、肿瘤纯度10%以上的样本检测准确率高达99%,速度相较于MSIsensor提升了10倍以上,典型的WES数据可以在180秒内完成检测,内存占用仅80M左右。MSIsensor2自发布以来已经被来自27个国家的1800多个用户使用,算法的准确性也得到著名的小鼠研究的麦加圣地--美国杰克森实验室(Jackson Lab)的高度评价。


MSIsensor-ct对ctDNA含量0.05%以上的cfDNA测序数据检测准确率也高达99%以上。需要特别指出的是,MSIsensor2与MSIsensor-ct都展现了较优的panel适用性,任何包含10个以上训练模型的panel检测样本MSI状态的精度达到95%以上,足以满足产业应用需求。



MSIsensor-ct系列算法已经被超过240余篇论文引用(google scholar),为国际上引用数最高的泛癌种NGS-MSI信号探测算法,支持超过20个国家的473个基因检测企业产品、药企的研发和科研团队的项目,实际检测超过115,000例癌症病人的MSI状态。

本次满分通过CAP能力验证,是对求臻医学检测能力及生信分析能力的双重肯定。未来求臻医学将一如既往的以高标准严格要求自己,严格把控检测每个环节,确保肿瘤基因检测质量的稳定性及检测结果的准确性,持续以更专业、一流的检测水平为肿瘤精准医疗事业的发展贡献力量!


CAP介绍

CAP美国病理学家协会(COLLEGE OF AMERICAN PATHOLOGISTS,CAP)是世界最大的病理学家组织,被公认为实验室质量保证的领导者。CAP认证是由美国病理家协会举办的临床实验质量认证计划。自1962年起在美国普遍采用执行,1994年起被世界各国公认为最适合医学实验室使用的国际级实验室标准,通过CAP认证,代表着求臻医学品质达到世界顶尖水准,并获得国际各相关机构认同。