人全基因组重测序
全基因组重测序 (Whole-genome sequencing,WGS)是全面分析基因组的方法。利用Illumina测序全面挖掘DNA水平的遗传变异,为筛选疾病的致病及易感基因,研究发病及遗传机制提供信息。
优势:数据质量高、定位准确、分析实力强
应用:
求臻医学 变异检测
求臻医学 分子诊断
求臻医学 单基因遗传病
求臻医学 复杂疾病
求臻医学 肿瘤研究
求臻医学 群体研究
人全外显子测序
全外显子测序 (Whole-exome sequencing,WES)是应用频率最高基因组测序方法。外显子是人基因组的蛋白编码区域,利用序列捕获技术可以将其DNA捕获并且富集。虽然外显子区域不到全基因组的2%,但是却集中了大部分疾病的致病突变位点。
优势:性价比高、周期短、探针种类多
应用:
求臻医学 单基因遗传病
求臻医学 复杂疾病
求臻医学 肿瘤研究
求臻医学 功能基因
求臻医学 致病机理
circRNA
环状RNA(circularRNA,circRNA)是一类闭合、成环的非编码RNA分子,对核酸酶不敏感,半衰期较线性RNA长。circRNA广泛存在于动植物中,研究显示其能够通过竞争性结合microRNA在转录后水平进行调控。基于高通量测序技术,针对有参考基因组样本开展准确的circRNA鉴定以及来源基因的分析,环状RNA测序在医学、农学研究领域应用越来越广泛。
优势:
求臻医学 领先的建库方法
求臻医学 获得最全面的circRNA信息
求臻医学 实现深层次的ceRNA分析
应用:
求臻医学 在转录,转录调控及表观遗传水平上调控基因表达
求臻医学 作为疾病的生物标志物
求臻医学 发育生物学领域
LncRNA
LncRNA(长链非编码)是一类长度大于200nt但一般不编码蛋白质的RNAs,广泛存在于动植物中,采用去除rRNA或DSN真核生物全转录组建库的方法进行文库构建,通过illumina测序平台,针对有参考基因组样本开展准确的lncRNA鉴定和lncRNA靶基因预测,同时提供针对测序数据中mRNA的分析,结果更全面,广泛应用于医学、农学研究领域。
优势:
求臻医学 项目经验丰富
求臻医学 一种文库获得mRNA,lncRNA和circRNA数据
求臻医学 覆盖标准分析,高级分析和个性化分析
应用:
求臻医学 新lncRNA找寻与预测
求臻医学 疾病研究
求臻医学 调控网络研究
SmallRNA
SmallRAN是一类高度保守其长度介于18-32nt的RNA分子,主要包括microRNA(miRNA)、smallinterfering(siRNA)、piwi-interactingRNA(piRNA)三大类,求臻采用Illumina HiSeq平台,可针对样本中的miRNA、siRNA、piRNA展开全面分析,既能鉴定已知sRNA、也能预测新的sRNA并预测sRNA的靶基因,为研究small RNA功能及调控机制提供有力手段。
优势:
求臻医学 项目经验丰富
求臻医学 可对miRNA、siRNA、piRNA展开全面分析
求臻医学 覆盖标准分析,高级分析和个性化分析
应用:
求臻医学 基因转录后调控研究
求臻医学 基因沉默研究
求臻医学 small RNA靶标分析和调控网络
真核有参转录组
有参转录组研究的是特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有的mRNA的总和,利用illumina测序平台,快速全面将特定组织或细胞中的差异基因和转录本信息全部获取出来的过程。
优势:
求臻医学 平台优
求臻医学 周期短
求臻医学 生信实力强
应用:
求臻医学 基因表达差异分析
求臻医学 发掘新基因
求臻医学 RNA编辑分析(可变剪切、SNP、融合基因)
表观组
DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息,获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据,对表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。Bisulfite甲基化测序是以新一代高通量测序平台为基础,结合全基因组Bisulfite处理和生物信息数据分析技术,进行低成本、高效率、高准确度的全基因组DNA甲基化水平图谱绘制。
优势:
求臻医学 丰富的项目经验
求臻医学 精准的甲基化定位
求臻医学 领先的建库技术
应用:
求臻医学 基因表达调控
求臻医学 遗传印记
求臻医学 胚胎发育
求臻医学 表观异质性
宏基因组测序
宏基因组学(Metagenomics),也称元基因组学,利用新一代高通量测序技术(NGS)以特定环境下微生物群体基因组为研究对象,在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上,可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系,发掘潜在的生物学意义。与传统微生物研究方法相比,宏基因组测序技术规避了绝大部分微生物不能培养、痕量菌无法检测的缺点,因此近年来在环境微生物学研究中得到了广泛应用。
优势:
求臻医学 丰富的项目经验
求臻医学 先进的拼接技术
求臻医学 物种注释广泛
应用:
求臻医学 人体领域
求臻医学 环境(空气,水体,土壤)
求臻医学 工业领域
宏转录组测序技术
宏转录组测序技术(Metatranscriptomic sequencing)通过对特定时期、特定环境样品中所有微生物群落的转录本进行大规模高通量测序,可以直接获得环境中可培养和不可培养的微生物转录组信息。这种技术不仅具有宏基因组技术的全部优点,可以检测环境中的活性微生物、活性转录本以及活性功能进行研究,还可以比较不同环境下的差异表达基因和差异功能途径,揭示微生物在不同环境压力下的适应机制,探索环境与微生物之间的互作机理。
优势:
求臻医学 丰富的项目经验
求臻医学 先进的拼接技术
求臻医学 物种注释广泛
应用:
求臻医学 人体领域
求臻医学 环境(空气,水体,土壤)
求臻医学 工业领域
微生物多样性测序
微生物群落多样性分析是利用二代高通量测序技术,通过测定微生物的16S rDNA、18S rDNA以及ITS高变区域序列信息来分析环境中细菌、古细菌以及真菌的种类组成和结构,揭示环境样品中微生物种类以及它们之间的相对丰度、进化关系,进一步探讨微生物多样性;该技术对于研究微生物与人类医疗健康、食品安全、环境检测与治理、微生物资源的利用等有着重要的应用意义。
16S rDNA测序:16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,采用HiSeq或最新的MiSeq测序仪,对16S rDNA某个高变区进行测序,通过生物信息分析环境微生物中细菌或古细菌的多样性。
18S rDNA测序:18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。在结构上分为保守区和高变区,保守区反映生物物种间的亲缘关系,高变区反映物种间的差异。
ITS测序:ITS分为两个区域:ITS1/ITS2,其中ITS1位于真核生物核糖体rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于真核生物核糖体rDNA序列5.8S和28S之间。对ITS1或者ITS2进行测序,通过生物信息分析环境微生物中真菌多样性。
优势:
求臻医学 读长长
求臻医学 周期短
求臻医学 性价比高
应用:
求臻医学 人体领域
求臻医学 环境(空气,水体,土壤)
求臻医学 工业领域