近年来，全球基因组学的行业应用不断取得突破，DNA测序成本持续降低，个人的基因组测序成本从30亿美元降至如今的500美元。在临床应用方面，以肿瘤诊疗为代表，基因检测在疾病的先期预防、伴随诊断、个体化用药及后续疗效监测等整个流程均大有用武之地。
第二十二届全国临床肿瘤学大会暨2019年中国临床肿瘤学会（CSCO）学术年会上，求臻医学举办了「求无止境·臻准践行」专题卫星会，对基因检测技术向肿瘤临床应用转化进行了精彩讨论。丁香园作为行业内一流平台，现场采访了求臻医学首席医学官王东亮博士，深度探讨了基因检测在临床应用方面的现状及其未来发展。
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王东亮博士您好，中国基因检测市场目前正处于高增长状态，在推动基因检测技术加速走向临床转化方面存在哪些问题，为了满足市场需求，求臻医学主要做了哪些工作？
王东亮博士：虽然中国肿瘤基因检测市场蓬勃发展，但目前行业中仍面临几大主要问题：
1.NGS临床缺乏行业标准。NGS虽已在肿瘤领域中广泛应用，但其在肿瘤样本采集、运输、储存、检测、生物信息学分析、遗传咨询解读等环节尚缺乏标准化流程，即便对于同一份样本，多家检测机构的结果也都有可能会存在一定差异；
2.缺乏共享机制。尽管中国基因检测数量庞大，但各研究单位数据资源缺乏共享机制，医生之间、医院之间的基因数据没有横向沟通，存在信息孤岛，导致很多基因数据缺乏临床表现支持，即临床治疗后缺乏疗效、愈后、不良反应之间的关联；
3.缺乏肿瘤基线。国人高发肿瘤基线突变特征不清晰，缺乏反映国人肿瘤分子特征的基因图谱。
基于这些基因检测行业亟待解决的问题，由国家人类遗传资源中心牵头，求臻医学作为承担单位，联合全国50多家三甲医院的顶级肿瘤专家共同参与的中国肿瘤基因图谱计划已经全面开展。项目研究内容包含乳腺癌、胃癌、结直肠癌、肺癌、肝癌等课题，以期绘制中国肿瘤基因图谱，建立行业标准、制定肿瘤多基因大Panel检测的专家共识。
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中国肿瘤基因图谱关于行业标准制定是否有具体规划？
王东亮博士：项目预计在三年内检测1万例肿瘤患者样本，并对这1万例样本患者的后续疗效、预后进行定期随访与跟踪，以收集临床数据，建立基因数据库，绘制中国肿瘤基因图谱，并制定行业相关标准，为肿瘤精准医学诊断提供科学依据。
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在进行肿瘤基因检测时，既有针对某一癌种常见基因变异的小Panel检测，也有类似TrusightTMOncology 500（TSO500）这种涉及上百个基因的大Panel。二者的应用场景各是怎样的？
王东亮博士：小Panel是单基因或者少数基因的组合，能够指导患者的靶向用药，为靶向治疗提供依据。现如今，随着免疫治疗成为肿瘤治疗领域的革命性突破，大Panel日益受到追捧。例如，免疫治疗有两个非常重要的标志物——肿瘤突变负荷（TMB），以及微卫星不稳定状态（MSI）。这两个指标都需大Panel才能更好地被检测出来，进而为免疫治疗提供指导。
且在临床治疗过程中，肿瘤基因组非常复杂，单看某个基因突变，临床治疗效果千差万别，若有其它基因同时突变，也会对临床用药影响巨大。因此，大Panel的基因检测结果将影响患者用药的疗效，帮助临床医生将靶向药的效果发挥到极致。
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在临床应用方面，大小Panel是否有优劣之分？
王东亮博士：谈不上优劣之分，患者可以根据自身对于治疗疗效的预期或者治疗方案进行选择。例如，有些患者的经济承受能力只局限于进入医保的靶向药，选择小Panel即可。但有些患者追求靶向、免疫治疗疗效最大化，最好选择大Panel。
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随着测序成本不断下降，基因检测的数据量也愈发庞大，这对生物信息分析水平提出了较高的要求。您如何看待这一问题？求臻医学是怎样帮助解决这一问题的？
王东亮博士：大数据时代，如何深度挖掘基因检测的临床数据更为重要，求臻医学在生物信息学领域独具优势。
首先，求臻医学首席科学家李蔚教授是全球顶尖的生物信息专家，对于大数据的处理和挖掘，以及生信算法等方面造诣非常深厚。其次，肿瘤免疫治疗非常重要的一个标志物就是微卫星不稳定状态。业内主流微卫星不稳定状态算法MSIsensor的开发者——求臻医学首席信息官。他基于人工智能机器学习的办法，使庞大的基因检测数据库能更好地与临床治疗结合。
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近年来兴起的免疫治疗被认为是有可能将癌症变为慢性病的疗法。不过，由于免疫系统的复杂性，目前筛选受益患者的方法尚不能完全令人满意，您认为解决这一问题的方向有可能在哪里？
王东亮博士：通过TMB、MSI的检测，可以切实提升肿瘤患者接受免疫治疗疗效的把握程度，但各类检测机构的算法结果差异较大。TSO500大Panel检测产品的TMB及MSI指标，与全外显子检测及PCR法有着非常优异的一致性，并已联合国际顶尖的企业及科研机构，开展了「TMB一致性的评价」项目，共同推进TMB的标准化，更好地解决临床阶段免疫治疗疗效预测指标不足够稳定的问题。
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在精准医学理念深入人心的当下，医生与患者对肿瘤基因检测的接受度日益提高。在您看来，基因检测应用于指导诊断与治疗，目前还有哪些短板有待加强？
王东亮博士：基因检测是一项先进的技术，但与临床应用之间仍存在着鸿沟。首先，基因检测包含样本采集、运输、提取、建库、上机、生物信息分析、遗传咨询、报告解读等等流程，过程繁杂、链条长，由于临床医生未能完整地参与其中的各个环节，导致临床阶段对于肿瘤基因检测技术了解不足够深入；其次，肿瘤基因检测企业与临床阶段也存在着沟通不足，企业的研发成果并不能很好的解决临床问题。
为了解决上述问题，求臻医学从临床应用问题出发，与临床医生进行深度交流，深入扎根临床实际需求，力争打通先进技术和医生之间的鸿沟。
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求臻医学在推动基因检测更好落地的过程中具体有哪些举措？
王东亮博士：一方面，求臻医学承担了由国家人类遗传资源中心牵头的中国肿瘤基因图谱计划，有希望能够解决NGS行业标准欠缺、基因检测数据壁垒、中国肿瘤基因图谱缺失等问题；另一方面，求臻医学引进了全球最顶尖的肿瘤基因检测产品——TSO500：由Illumina研发，已获得FDA突破性器械待遇，已进入绿色审批通道；依据标准化测序流程、双端UMI设计、严谨的研发、验证数据，可以更优化的解决肿瘤领域的临床问题。
与此同时，求臻医学始终将创新驱动放在首要位置，截至目前，我们已经拥有13项发明专利及46项基于肿瘤大Panel的生信软件著作权，我们的科学家团队已发表SCI文章200余篇，其中30余篇发表于业内顶级的Nature、Cell及其子刊。
结语
虽然肿瘤药物的上市数量及速度已经趋缓，但通过肿瘤检测，可以发现更多的已上市及临床研究中药物的疗效、预后标志物，肿瘤基因检测每一天都在改变临床实践。在采访的最后，王东亮博士也通过丁香园表示，希望未来医院及检测企业能够一起携手，在算法、检测结果验证、技术研发等方面，以临床问题为出发点，切实地解决患者的需求，为实现「健康中国2030」的愿景而不懈努力。
王东亮博士
具备丰富的肿瘤治疗临床经验，擅长恶性肿瘤的内科治疗及免疫治疗的临床应用，开展；
发表过学术论文15篇，承担省级课题2项，院内基金重点项目1项，参与国家自然科学基金项目1项；
中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会胃癌标志物协作组常务委员，中国医疗保健国际交流促进会结直肠病专业委员。
