今天的臻解密，将用大白话告诉你docker是什么……

docker是什么？

如果拿现实中的例子，那它就类似是个集装箱。

为什么是docker或者说它的优点是什么？

集装箱的运输是很方便的，可以放在陆地，也可以放在船上，行驶在世界各地。OK，那么docker类似的功能是，打包好的东西可以在Windows、Mac以及Linux上运行，不受环境限制。

docker为什么在生信分析中广泛得到应用？

简单的讲，生物信息分析这个过程中所依赖的分析软件实在太多了，小编就亲身经历就安装过近300款分析软件，而且还不包括R、perl以及python这样的基础底层软件所依赖的开发包。如果有了docker，构建一次生信环境，加上docker灵活的可移植性，简直是完美。

构建docker镜像的原则方法？

由于生物信息软件的多样性，因此没有必要一次性把所有分析软件打包到一个docker中，而是根据不同的分析需求构建不同的集装箱。

寻找基础镜像？

在构建docker镜像的过程中，我们可以找一个合适的外壳，比如红色的蓝色的，这里的外壳我把称为基础镜像，基础镜像一般选择都是linux系统，可以选择centos、ubuntu，这两者的区别就是centos比较稳定，更新的库文件比较保守，ubuntu更趋向于向前更新，这里推荐centos。

docker又一大优点：镜像累积

比如你刚刚弄好了一个集装箱A，如果再往里面加点东西就可能适应一个新的分析流程。OK，别急，你可以把集装箱A 当作基础镜像，再往里面加新东西，生产新的镜像也就是集装箱B。

docker 的资源汇总？

首先是官网，通过官网你可以下载docker软件，通过该软件你可以构建形形色色的docker镜像。

官网：http://www.docker.com

其次是社区，通过开源的公共社区，你可以共享在开源社区别人已经构建好的docker镜像，包括基础镜像的选择。

社区:https://hub.docker.com/

再者就是国内镜像，通过设置国内的镜像加速，你可以更快的从社区网站下载或者上传docker镜像。

阿里云的加速器：

https://help.aliyun.com/document_detail/60750.html

网易加速器：http://hub-mirror.c.163.com

官方中国加速器：https://registry.docker-cn.com

ustc的镜像：https://docker.mirrors.ustc.edu.cn

构建自己的镜像？

这一部分就是要开发者自己去实践了，如何构建docker镜像，其中的一些命令，小编在这里推荐一个在线网站，搞定一切：

http://www.runoob.com/docker/docker-tutorial.html

 最后，一如既往的放大招：

小编为了便于各位开发者特别是生信分析人员，特地在此放出了小编构建好的基础镜像，以此为基础，结合docker的良好扩展性，开发者可以任意构建某一分析流程的特色镜像。这一基础镜像以centos为基础，构建了R、perl、java、python2、python3等，并安装了一些常规的分析软件包。话不多少，直接给出镜像地址：https://hub.docker.com/r/fanyucai1/base

此外小编还基于该基础镜像，进一步封装了一个可用于变异检测分析的docker镜像，其镜像地址如下：

https://hub.docker.com/r/fanyucai1/bio_tumor